《古宝奇缘3之迷踪》讲述了金讯管道工程队在施工装管道时意外挖出一座古墓，并发现一枚价值连城的千年古刀币。然而，刀币出土当晚，队长猴子竟与古刀币一同神秘失踪。副队长大飞随即召集全体队员展开调查，耗子、红红、胡子、二愣以及工程队会计张会计，都因各自的动机被列为杀害猴子的嫌疑人。随着调查深入，大飞也逐渐显露出作案可能，甚至有人怀疑，他主动组织查案，正是为了找出一个替自己杀人罪行顶罪的替罪羊。如此一来，工程队所有人都可能与猴子的死亡及古刀币失窃有关。就在案情愈发扑朔迷离之际，众人推理出猴子或许是驾车意外坠湖身亡，本以为真相即将水落石出，却发现这一切竟陷入一场早已被人精心设计的惊天阴谋。古刀币最终将落入谁手，猴子究竟是被谁所杀，隐藏已久的玄机也随之逐渐浮出水面。
