《孤舟》讲述了苏州顾家子弟顾易中（曾舜晞 饰）的抗战经历。他从宾夕法尼亚大学建筑系毕业后回国，抗战爆发不久，因参与协助地下党营救女友的行动失败，导致苏州地下组织的联络点全部暴露。日伪趁机对他栽赃陷害，使他被误认为党内叛徒。面对无法证明清白的困境，顾易中主动打入日伪内部，历经重重波折，最终成为我党潜伏在苏州特工站中的人员。
在巨大的压力下，顾易中与苏州特工站站长周知非（张颂文 饰）及日军顾问近藤利男展开周旋，并伺机查出党内真正的叛徒“黑八”，将其铲除。他不断为我党秘密搜集情报，多次在危急关头救出党内同志，为苏州地下组织的抗日救国斗争提供了重要支持。在一次次生死考验中，顾易中始终坚守信仰，逐渐成长为一名坚定的抗日战士。
