十二猴子第三季将以一种十分罕见的方式播出：5月19日至5月21日连续三天放出全部10集，首日播出4集，之后两天每天播出3集。本剧已提前续订第四季，而第四季也将成为全剧的最终季。
第3季第1集《Mother》中，2163年的世界已经陷入末日，Cole不顾一切地追寻Titan；与此同时，被捕的Railly被迫面对一个艰难的选择，十二猴子军则在等待见证者The Witness降临。第2集《Guardians》中，Cole与Jones前往第一次世界大战结束后的法国寻找Jennifer Goines，却在那里遇上了一支危险的时间旅行队伍——守护者Guardians。第3集《Enemy》中，Ramse带着一名被俘的宿敌返回基地，彼此之间的信任因此受到考验；为了查明真相，Cole和Jones又将做出怎样的选择？第4集《Brothers》中，Ramse与Cole鼓起勇气前往2007年——…
