《金刚：骷髅岛》将故事设定在上世纪70年代。一支由科考队员、探险家、战地摄影记者和军人组成的探险队，踏上了南太平洋神秘的骷髅岛。刚一登岛，他们便因行动惊扰了岛屿的守护者——史上最大的金刚，随即爆发了一场惨烈激战，探险队成员也因此被迫分散到岛上的各个角落。
在危机四伏的丛林中，队员们逐渐发现，这次行动远不只是一次普通的科考任务，他们真正要寻找的是怪兽存在的证据。与世隔绝的骷髅岛上，潜伏着数量众多、形态诡异的史前生物，随时可能夺走他们的生命。与此同时，他们还遇见了神秘的原始部落，并一步步揭开金刚的身世，以及它为何守护这座岛屿。随着真相浮出水面，众人意识到，在这片阴森恐怖的土地深处，还隐藏着比金刚更加凶残可怕的怪兽。
