《少林豪侠传》以晚清为背景，南派少林武功传人黄飞鸿（王群饰）在佛山一带早已声名远播。一天，他带着徒弟梁宽（谭俏）和牙擦苏（黄一山饰）前往广州，接应从美国归来的十三姨（郭秀云饰）。途中经过铁路工地时，三人无端遭到工程总管十一少的粗暴对待，双方因此发生冲突。后来，黄飞鸿又因阻止十一少在闹市胡作非为而与其结怨渐深。
与此同时，黄飞鸿深受猪肉荣等当地百姓爱戴，众人恳请他在广州开设宝芝林，传授武艺、行医济世。宝芝林开张当天，十一少派出狮队前来抢青捣乱，还企图借洋人之手除掉黄飞鸿，只是最终因技不如人而未能得逞。原来，十一少是关帝厅头目，仗着何提督撑腰，暗中从事贩卖鸦片、人口等罪恶勾当，早已将黄飞鸿视为心腹大患。
得知黄飞鸿与反清志士有所往来后，十一少向提督告密，导致黄飞鸿被捕入狱并遭受凌辱。众人为营救黄飞鸿四处奔走，恰逢提督迫于洋人压力，只得将他释放，却下令把黄飞鸿等人逐出广州。黄飞鸿心中不平，离开途中经过铁路工地时，意外得知十一少等人贩卖人口的罪证。为了匡扶正义并救出牙擦苏，他决定深入虎穴。
