《宝石之国》的故事设定在遥远的未来。那时，地球上生活着一群由宝石构成的人形生命体。自诞生以来，他们便不断遭到掠夺，如今全世界只剩下28名宝石人。神秘种族“月人”现身后，开始对宝石人展开袭击，将他们残酷地制成装饰品，甚至加工成武器。
脆弱而缺乏韧性的磷叶石（黑泽朋世 配音）、能够释放银色毒液的辰砂（小松未可子 配音）、憧憬浪漫爱情故事的钻石（茅野爱衣 配音）、一心投入战斗的圆粒金刚石（佐仓绫音 配音），以及性格活泼开朗的摩根石（田村睦心 配音），与其他幸存的宝石人一同面对月人的威胁。为了抵抗入侵，宝石人们决定携手作战。
