《超级机器人大战OG·the inspector》的故事背景设定在新西历。尽管人类已经正式迈入宇宙开发的第二世纪，但由于两次大型陨石坠落，社会生活仍停留在21世纪初的水平。新西历179年，第三颗陨石“流星3（メテオ3）”坠落在南太平洋的マーケサズ群岛海域。地球联邦政府展开调查后发现，这并非普通陨石，而是由人类尚未掌握的技术制造而成的物体，这种来自地球之外的技术被命名为EOT（Extra over technology）。
为深入研究EOT，地球联邦政府成立了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”。随后，EOTI机关代表比安博士公布研究结果，指出地球正面临来自宇宙生命体的侵略危机。以此为契机，人型机动兵器Personal Trooper的研发正式启动。
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