《黑子的篮球·终极一战》讲述了黑子哲也与火神大我加入诚凛高中篮球队后的故事。火神拥有出众的篮球天赋，而黑子则是一名在赛场上几乎没有存在感的球员。事实上，黑子曾是篮球名校帝光国中篮球队的一员，和被誉为奇迹时代的五位天才并肩作战，并以梦幻的第六人身份活跃于球场。凭借黑子的影与火神的光，两人逐渐成为诚凛的核心主力，带领球队闯入冬季选拔赛，接连击败拥有奇迹时代成员的强敌，最终夺得全国冠军。
升入高二后的暑假末，一支由一群年约18岁的美国篮球天才组成的街球队伍Jabberwock来到日本，并与日本男篮国家队进行友谊赛。面对这支实力悬殊的对手，日本队遭遇惨败，Jabberwock甚至出言嘲讽。诚凛高中篮球队教练丽子的父亲景虎因此被彻底激怒。这位曾经的日本篮球国手决定召集黑子、火神以及奇迹时代的其他成员，临时组建梦幻球队VORPAL SWORDS，向Jabberwock发起复仇。一场决定胜负与尊严的激烈对决就此展开。
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