《心灵想要大声呼喊》讲述了少女成濑顺（水濑祈 配音）的故事。年幼时，她因口无遮拦而引发家族悲剧，从此仿佛被封印了语言，再也无法开口说话。长久以来，顺沉浸在悲伤之中，与周围的人保持距离，也将自己的内心彻底封闭起来。
某天，浑浑噩噩的少年坂上拓実（内山昂辉 配音）、因受伤而无法继续棒球梦想的田崎大树（细谷佳正 配音）、正为恋情烦恼的拉拉队员仁藤菜月（雨宫天 配音）以及成濑顺，被老师安排共同参加“地域沟通交流会”。四人需要在交流会上表演一出音乐剧，但班上的大多数学生对此并不感兴趣。争执之中，顺却突然开口，主动承担了演唱的任务。
