《黎明绝杀》讲述了1950年新中国成立初期的剿匪斗争。营长赵红旗原名廖少勇，早已与原来的家庭和阶级彻底决裂。为了重返家乡青顺，他肩负起剿灭当地顽匪的任务，却意外发现匪首竟是自己的双胞胎兄弟廖少侠。赵红旗乔装潜入山中的匪巢，廖少侠则因神秘特务老鸭提前获得情报，化装下山侦察。立场不同的兄弟由此展开了一场生死较量。
同年，国民党特务组织根据国际局势和大陆形势，启动了代号重光的庞大计划，老牌特务老鸭也秘密潜入贵州。为粉碎敌人的阴谋，我军派出独立营进入贵州作战。赵红旗接连挫败老鸭等人的行动，成功摧毁国民党在西南地区的情报网络。在剿匪和稳定社会秩序的过程中，西南地区的商业逐步恢复，人民币的使用得到推广和巩固，新生的人民政权因此赢得了百姓拥护。与此同时，赵红旗成功策反女土匪梨花，使她投身剿匪斗争，并为最终胜利作出了重要贡献。
