《夫妻时差》讲述了一对白领夫妻毛奇和林楠原本感情深厚，却因意外失去孩子而陷入婚姻危机。为了挽救这段关系，两人决定改变生活环境，移民加拿大。然而到了异国之后，他们才发现自己始终无法真正融入当地社会，精神也因此陷入极度苦闷。
妻子林楠由张庭饰演，她体谅丈夫，建议毛奇回国生活；但毛奇由丁志诚饰演，不愿把妻子独自留在加拿大。面对彼此的坚持，两人逐渐意识到，他们之间依然存在深厚的感情，只是过去一直没有找到化解隔阂的方法。重新走到一起后，夫妻俩相互扶持、彼此依赖，共同开始了同甘共苦的新生活。
然而，平静的日子并未持续太久。一个年纪尚小的加拿大混血男孩海，由Collin Ken Bennett饰演，渐渐迷恋上林楠。他用摄像机记录林楠生活中的每个瞬间，起初遭到林楠的严厉拒绝和警告。直到海的母亲找到林楠，告诉她海身患绝症、生命所剩无几，林楠才开始重新看待这个孩子。
想到自己曾对儿子的离世无能为力，林楠决定竭尽全力帮助海延续生命。善良的毛奇起初十分支持她，但相处一段时间后，他发现海对林楠怀有深切的爱意，而林楠对海的关心也让他产生了嫉妒，再次陷入痛苦之中。察觉到丈夫情绪变化的林楠同样备受矛盾折磨。为了让林楠能够陪海走完最后一程，毛奇在痛苦思量后决定先回北京。
