香港经历SARS疫潮后，社会终于逐渐走出阴霾。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友去世的消息，因无法释怀而情绪崩溃，并陷入深深的自责与抑郁之中。法医岑雅晴（黎姿饰）一直陪伴在他身边，耐心鼓励他重新振作，找回生活与工作的信心。
急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束一段恋情后，又与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）陷入复杂的三角关系。心脏科医生林敏智（陈豪饰）不幸感染SARS并留下后遗症，为了维护自己的名声而选择隐瞒病情，却使身体状况持续恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）原本正计划共同生活，却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临感情上的考验。
由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3国语》，是《妙手仁心》系列的第三辑，由监制戚其义与编剧周旭明再度携手打造。剧集延续前两辑的风格与特色，在医务人员协助下进行实景拍摄，继续讲述医护人员在工作与生活中面对的种种挑战，以及他们之间交织的情感关系。
