《哈默尔恩》讲述了一个隐于群山深处的小村庄。这里人口稀少，曾经充满欢声笑语的小学如今早已没有孩子的身影。随着人口老龄化与过疏化日益严重，村庄逐渐显出衰老而沉寂的气息。前校长（坂本长利 饰）一直悉心守护着已经关闭的旧校舍，把它当作自己的孩子般珍惜不舍，但校舍最终仍难逃被拆除的命运。一天，在这所小学长大的野田（西岛秀俊 饰）回到了村里。如今身为博物馆馆员的他，因为校内即将出土绳文时期文物而奉派前来进行清查，同时也想寻找当年亲手埋下的时间胶囊。
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