《奇门遁甲粤语》的故事发生在清康熙二年。八旗总教头高雄因触犯满汉通婚禁令，遭肃亲王指使蝙蝠法师追杀。生死关头，高雄绑走肃亲王的小贝勒逃亡，却意外将小贝勒勒死。十四年后，江湖上声名显赫的“奇门”与“遁甲”是一对法力高强的师兄妹，二人性情古怪，却常常暗中帮助百姓。与此同时，高雄隐姓埋名多年，居住在他们所在的小镇，并将偶然收养的孤儿树根抚养成人。没过多久，高雄的真实身份被蝙蝠法师发现，对方再次展开追杀，更企图把树根伪装成当年失踪的小贝勒，借此掌控朝廷。高雄与蝙蝠法师激战后身亡，孤立无援的树根只好向奇门、遁甲求助，随即卷入一场场诡谲奇异的法术较量。
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