《诸天纪》讲述了少年林飞的逆天重生之路。传说黑渊每次现世，都会引发足以毁灭诸天万界、令宇宙重新开始的天道大劫。因筋脉有缺，林飞始终无法修行，只能凭借小聪明待在问剑宗混日子。直到大劫降临，恩师和挚友相继战死于黑渊，他才为自己虚度的岁月悔恨不已。
在经历重重磨难后，林飞另辟蹊径，修成上古炼器法，为师门复仇，并最终与魔头渊皇同归于尽。然而，在神秘力量的影响下，他竟于重启后的新纪元重获新生。为了守护由神秘人从大劫中传承下来的问剑宗，也为了避免相同的悲剧再次发生，林飞决定从一名边缘弟子重新起步，踏上修炼万剑之道、汇聚群英之力的道路，誓要打破天道大劫，延续文明的火种。
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