《超级飞侠第十二季》中，超级飞侠继续接听来自世界各地小朋友的求助电话，根据他们的需要定制特别物品，并将礼物及时送到手中。当小朋友遇到难题时，乐迪会向总部求援，超级飞侠则带来拥有不同属性的愿望能量球，与小朋友一起变身为酷炫的愿望守护者，共同想办法解决困难。
上一季加入团队的三位新成员——恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯和高速火车超级飞侠咚咚，也将在本季继续大显身手。随着挑战不断升级，超级基地还会化身超级机器人，与超级飞侠并肩作战，陪伴小朋友们度过一个又一个难关。
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