在一个晴朗而毫无预兆的日子里，一枚导弹突然袭来，将东京都标志性的彩虹桥拦腰炸断。事件在东京引发巨大骚动。不久之后，警视厅公安部外事三课的警部高畑慧（高岛礼子饰）携带相关影像资料来到由藤田继次（筧利夫饰）率领的特车二课。经过分析，他们发现袭击者使用的，正是此前从自卫队失窃的新型战斗直升机AH-88J2改“灰色幽灵（Grey Ghost）”。
高畑慧进一步透露，这起恐怖袭击与拓植行人、灰原零（森カンナ饰）存在直接关联。与此同时，特车二课也陷入了即将被撤销的危机。随着东京一千万人口沦为暴动分子的人质，这座国际大都市面临前所未有的灾难。泉野明（真野惠里菜饰）与她的LABOR，能否在这场危机中力挽狂澜？
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