2043年7月1日，犯罪大王将军（卢惠光饰）落网。一周后，铁面无私的法官余铁雄（张卫健饰）将亲自审理此案。为逃避审判，将军派手下健（郑伊健饰）穿越回50年前，寻找年轻时的余铁雄，并对他进行洗脑，让他失去审判能力。政府得知计划后，派出飞龙特警铁面（刘德华饰）、扫帚头（张学友饰）和发达星（任达华饰）返回1993年，负责保护余铁雄。
此时的余铁雄还是一名在1993年某中学长期留级的大雄，平日经常遭到同学余忌安（许志安饰）的戏弄和殴打，只有女友采妮（杨采妮饰）真心对待他。三名特警分别潜入学校：扫帚头化身教师，铁面成为大雄的同学，发达星则当上他的跟班。他们不仅帮助大雄打败余忌安，还试图从他口中打听余铁雄的下落，没想到大雄却坚称学校里根本没有这个人。与此同时，健也伪装成老师混入校园，而大雄的母亲正准备改嫁给理查德余。面对接连而来的变故，飞龙特警能否顺利完成保护余铁雄的任务？
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