《探案录骨笛魔音》中，上海接连发生离奇命案，闫飞经过调查，发现幕后真凶竟是一名丧失神识、力大无穷的改造人。随着改造人在各处肆意杀人，社会陷入一片混乱。危急关头，黄俊凭借神笛之音控制住局面，并因此受到段司令提拔，成为新任市长。
黄俊与闫飞联手追查事件背后的真相，线索逐渐指向日本731部队，而闫飞的父亲也被改造成了怪物。就在此时，失踪一年的白凌突然现身，提出与闫飞合作对付黄俊。她指出，黄俊是一个能力极强的魔头，一年多前曾借助日本人的实验室复活父亲黄朗，还成功将活人改造成不死战士，妄图征服世界。
与此同时，黄俊设下圈套，令闫飞误杀了自己的父亲。面对接踵而来的阴谋与重重危机，众人将如何战胜逆境，揭开最终真相？
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