《宝贝老板2》的故事发生在首部电影多年之后。邓普顿兄弟蒂姆和泰德已经长大成人，彼此的关系也渐渐疏远。如今，蒂姆结婚生子，与被称为超级妈妈的妻子卡罗尔、聪明过人的7岁女儿塔比莎，以及刚出生、可爱至极的女儿蒂娜一起生活在郊区；泰德则成为一名对冲基金首席执行官。塔比莎就读于一所声望卓著的教育机构，崇拜叔叔泰德，并希望成长为像他一样的人，这让蒂姆担心女儿过于用功，反而失去本该拥有的童年。与此同时，一个拥有先进理念、行事积极的新任宝贝老板出现，促使兄弟二人重新建立联系，并共同推动新的家族事业。当蒂娜作为宝贝集团最高机密特工的真实身份曝光后，蒂姆和泰德得知她肩负着揭开塔比莎所在学校及其神秘创始人阿姆斯特朗博士背后黑暗秘密的任务。兄弟俩因此以意想不到的方式再次并肩，重新审视家庭的意义，也终于明白什么才是生命中最重要的事。
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