《秀逗魔导士》的故事发生在一个以中世纪欧洲为基础的奇幻世界。这里不仅有人类，还生活着龙、精灵和哥布林。神与魔长期争斗：神为了守护世界而战，魔则企图夺取长杖、毁灭世界。赤眼魔王与赤龙神为了各自的目的展开对决，最终赤眼魔王被赤龙神击败，并被分成七个部分。为了防备魔族再次行动，赤龙神化身为四个分身，分别镇守世界四方。
一千年前，赤眼魔王的一部分苏醒，并率领魔族向赤龙神的分身之一水龙王发起挑战。赤眼魔王的五名部下中有四人布下结界，随后赤眼魔王与魔龙王联手直接挑战水龙王。然而，这场行动最终以失败告终，魔龙王也因此被封印，魔族的活动逐渐沉寂。
一千年后，自称“天才美少女魔导士”的莉娜·因巴斯登场。她在森林中遭遇盗贼时，得到流浪佣兵高里·卡布列夫的帮助。此后，高里自称莉娜的监护人，与她结伴踏上旅途。而两人的命运，也由此与魔王产生了无法割舍的联系。
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