汽车人与霸天虎延续数个世纪的战争从未真正停歇。如今，他们的后代巨无霸与原始兽又将这场宿命之战带到了史前时代。为了寻找新能源，霸王龙（David Kaye 配音）率领原始兽进行时空跳跃，抵达远古地球；擎天圣（Garry Chalk 配音）则带领巨无霸紧随其后。双方很快再次陷入僵持，连早已栖居于这颗星球上的外星人沃克人也被卷入其中。
穿越时空而来的巨无霸与原始兽携带着来自未来的信息，令沃克人深感恐惧，也让战局进一步升级。随后，霸王龙发现了汽车人遗留在地球上的战舰方舟号。为了改写霸天虎最终战败的历史，原始兽企图摧毁仍处于沉睡状态的擎天柱。一场关系到整个宇宙命运的战争，就这样在远古时代提前拉开了序幕。
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