《排球少年第二季》讲述了日向翔阳与排球之间的故事。小时候，他偶然从电视上看到乌野高中一名身材矮小的球员在赛场上大放异彩，那道被称为“小巨人”的身影深深印在他的心里，也让他从此爱上排球，并立志成为那样的选手。
进入初中后，日向因为排球部人数不足，只能一直等待队友加入。好不容易凑齐队员后，他终于迎来了人生中第一次、也是最后一次初中排球比赛，却偏偏在赛场上对阵实力最强的队伍，最终遗憾落败。那时的他明白，仅凭一个人的力量，绝不可能看到梦想中的景色；但如果身边有同伴，也许就能抵达那里。为了赢下真正属于自己的比赛，日向努力考入乌野高中，朝着成为“小巨人”的排球梦想继续前进。
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